Protein–RNA interactions for Protein: Q62431

Arid3a, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3aQ62431 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.19■■■■■ 5.47
Arid3aQ62431 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Arid3aQ62431 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Arid3aQ62431 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
Arid3aQ62431 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
Arid3aQ62431 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Arid3aQ62431 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Arid3aQ62431 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Arid3aQ62431 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Arid3aQ62431 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Arid3aQ62431 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Arid3aQ62431 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Arid3aQ62431 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.04■■■■■ 4
Arid3aQ62431 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Arid3aQ62431 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Arid3aQ62431 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Arid3aQ62431 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Arid3aQ62431 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Arid3aQ62431 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Arid3aQ62431 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Arid3aQ62431 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Arid3aQ62431 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Arid3aQ62431 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Arid3aQ62431 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
Arid3aQ62431 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Arid3aQ62431 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Arid3aQ62431 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Arid3aQ62431 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Arid3aQ62431 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Arid3aQ62431 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Arid3aQ62431 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Arid3aQ62431 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Arid3aQ62431 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Arid3aQ62431 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Arid3aQ62431 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Arid3aQ62431 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Arid3aQ62431 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Arid3aQ62431 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Arid3aQ62431 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Arid3aQ62431 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Arid3aQ62431 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Arid3aQ62431 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Arid3aQ62431 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Arid3aQ62431 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Arid3aQ62431 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Arid3aQ62431 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Arid3aQ62431 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Arid3aQ62431 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Arid3aQ62431 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Arid3aQ62431 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Arid3aQ62431 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Arid3aQ62431 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Arid3aQ62431 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Arid3aQ62431 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Arid3aQ62431 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Arid3aQ62431 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Arid3aQ62431 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Arid3aQ62431 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Arid3aQ62431 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Arid3aQ62431 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Arid3aQ62431 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Arid3aQ62431 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Arid3aQ62431 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Arid3aQ62431 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Arid3aQ62431 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Arid3aQ62431 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Arid3aQ62431 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Arid3aQ62431 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Arid3aQ62431 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Arid3aQ62431 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Arid3aQ62431 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Arid3aQ62431 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Arid3aQ62431 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Arid3aQ62431 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Arid3aQ62431 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Arid3aQ62431 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Arid3aQ62431 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arid3aQ62431 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Arid3aQ62431 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Arid3aQ62431 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Arid3aQ62431 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Arid3aQ62431 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Arid3aQ62431 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Arid3aQ62431 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Arid3aQ62431 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Arid3aQ62431 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Arid3aQ62431 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Arid3aQ62431 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Arid3aQ62431 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Arid3aQ62431 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Arid3aQ62431 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Arid3aQ62431 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Arid3aQ62431 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Arid3aQ62431 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Arid3aQ62431 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Arid3aQ62431 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Arid3aQ62431 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Arid3aQ62431 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Arid3aQ62431 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Arid3aQ62431 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms