RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030117.4

Smu1-201, Transcript of WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smu1, Length 2,418 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gjb2Q00977 226 aa21.54■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Stk3Q9JI10 497 aa21.54■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa21.54■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pof1bQ8K4L4 587 aa21.54■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Wdr93Q402B2 695 aa21.53■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 NcapgE9PWG6 1004 aa21.52■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fam184aE9PW83 1143 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Idi1P58044 227 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rufy3Q9D394 469 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Irx6Q9ER75 438 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Abcc10Q8R4P9 1501 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hoxc9P09633 260 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cct4P80315 539 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Bach2P97303 839 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Naa30Q8CES0 364 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Scn7aB1AYL1 1681 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa21.51■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Stx6Q9JKK1 255 aa21.5■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Brpf1B2RRD7 1212 aa21.5■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tlr7P58681 1050 aa21.5■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Samm50Q8BGH2 469 aa21.5■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pcmtd1P59913 357 aa21.49■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sytl4Q9R0Q1 673 aa21.49■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 CoilQ5SU73 570 aa21.49■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa21.49■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ube2hP62257 183 aa21.48■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 PtprvP70289 1705 aa21.48■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cnksr1A2A9K7 700 aa21.48■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Adcy5P84309 1262 aa21.47■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zfp51Q3U4L8 781 aa21.47■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Brf1Q8CFK2 676 aa21.47■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zap70P43404 618 aa21.47■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Syt1P46096 421 aa21.47■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 DpydQ8CHR6 1025 aa21.47■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Med4Q9CQA5 270 aa21.47■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Add2Q9QYB8 725 aa21.47■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hvcn1Q3U2S8 269 aa21.46■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zscan22Q8BGS5 496 aa21.46■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc178Q8CDV0 866 aa21.46■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Wdr78E9PYY5 807 aa21.46■■□□□ 1.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 EappQ5BU09 281 aa21.45■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmem132eQ6IEE6 982 aa21.45■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rad17Q6NXW6 688 aa21.45■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tti2Q8BGV4 512 aa21.45■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rps6ka5Q8C050 863 aa21.45■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Top1mtQ8R4U6 593 aa21.45■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Exoc6bA6H5Z3 810 aa21.44■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa21.44■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Bend3Q6PAL0 825 aa21.44■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atg3Q9CPX6 314 aa21.44■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tceal9Q9DD24 104 aa21.44■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mon2Q80TL7 1715 aa21.44■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Arfgef2A2A5R2 1792 aa21.44■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 EspnlQ3UYR4 1005 aa21.44■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Arap3Q8R5G7 1538 aa21.43■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nphp3Q7TNH6 1325 aa21.43■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa21.43■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mx2Q9WVP9 655 aa21.43■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 F2rP30558 430 aa21.42■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Babam1Q3UI43 333 aa21.41■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Echdc1Q9D9V3 322 aa21.41■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 TimelessQ9R1X4 1197 aa21.41■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fyb1O35601 819 aa21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 EzrP26040 586 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Map3k13Q1HKZ5 959 aa21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ifit2Q64112 472 aa21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cchcr1Q8K2I2 770 aa21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cfap73J3QPZ5 306 aa21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Usp48Q3V0C5 1052 aa21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Q9D9S1 216 aa21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rims2Q9EQZ7 1530 aa21.4■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Wdr24Q8CFJ9 790 aa21.39■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm10563F6WIE4 79 aa21.39■■□□□ 1.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cd22P35329 862 aa21.39■■□□□ 1.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fam228bQ497Q6 232 aa21.39■■□□□ 1.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa21.39■■□□□ 1.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kif3aP28741 701 aa21.38■■□□□ 1.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tgfb1i1Q62219 461 aa21.38■■□□□ 1.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 Taf5lQ91WQ5 589 aa21.38■■□□□ 1.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 1700006A11RikB9EHI3 544 aa21.38■■□□□ 1.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cdca7lQ922M5 438 aa21.38■■□□□ 1.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ptgs1P22437 602 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 79.1 ms