Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB8

Add2, Beta-adducin, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Add2Q9QYB8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
Add2Q9QYB8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Add2Q9QYB8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Add2Q9QYB8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Add2Q9QYB8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Add2Q9QYB8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Add2Q9QYB8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Add2Q9QYB8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
Add2Q9QYB8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Add2Q9QYB8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Add2Q9QYB8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Add2Q9QYB8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Add2Q9QYB8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Add2Q9QYB8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Add2Q9QYB8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Add2Q9QYB8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Add2Q9QYB8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Add2Q9QYB8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Add2Q9QYB8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Add2Q9QYB8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Add2Q9QYB8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Add2Q9QYB8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Add2Q9QYB8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Add2Q9QYB8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Add2Q9QYB8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Add2Q9QYB8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Add2Q9QYB8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Add2Q9QYB8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Add2Q9QYB8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Add2Q9QYB8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Add2Q9QYB8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Add2Q9QYB8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Add2Q9QYB8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Add2Q9QYB8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Add2Q9QYB8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Add2Q9QYB8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Add2Q9QYB8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Add2Q9QYB8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Add2Q9QYB8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Add2Q9QYB8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Add2Q9QYB8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Add2Q9QYB8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Add2Q9QYB8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Add2Q9QYB8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Add2Q9QYB8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Add2Q9QYB8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Add2Q9QYB8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Add2Q9QYB8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Add2Q9QYB8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Add2Q9QYB8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Add2Q9QYB8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Add2Q9QYB8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Add2Q9QYB8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Add2Q9QYB8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Add2Q9QYB8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Add2Q9QYB8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Add2Q9QYB8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Add2Q9QYB8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Add2Q9QYB8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Add2Q9QYB8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Add2Q9QYB8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Add2Q9QYB8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Add2Q9QYB8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Add2Q9QYB8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Add2Q9QYB8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Add2Q9QYB8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Add2Q9QYB8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Add2Q9QYB8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Add2Q9QYB8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Add2Q9QYB8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Add2Q9QYB8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Add2Q9QYB8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Add2Q9QYB8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Add2Q9QYB8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Add2Q9QYB8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Add2Q9QYB8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Add2Q9QYB8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Add2Q9QYB8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Add2Q9QYB8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Add2Q9QYB8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Add2Q9QYB8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Add2Q9QYB8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Add2Q9QYB8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Add2Q9QYB8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Add2Q9QYB8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Add2Q9QYB8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Add2Q9QYB8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Add2Q9QYB8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Add2Q9QYB8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Add2Q9QYB8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Add2Q9QYB8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Add2Q9QYB8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Add2Q9QYB8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Add2Q9QYB8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Add2Q9QYB8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Add2Q9QYB8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Add2Q9QYB8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Add2Q9QYB8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Add2Q9QYB8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Add2Q9QYB8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms