Protein–RNA interactions for Protein: P22437

Ptgs1, Prostaglandin G/H synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgs1P22437 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Ptgs1P22437 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Ptgs1P22437 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Ptgs1P22437 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Ptgs1P22437 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Ptgs1P22437 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Ptgs1P22437 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,62■■■■□ 3,29
Ptgs1P22437 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Ptgs1P22437 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Ptgs1P22437 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Ptgs1P22437 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Ptgs1P22437 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Ptgs1P22437 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Ptgs1P22437 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Ptgs1P22437 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Ptgs1P22437 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Ptgs1P22437 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Ptgs1P22437 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Ptgs1P22437 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Ptgs1P22437 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Ptgs1P22437 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Ptgs1P22437 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Ptgs1P22437 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,91■■■□□ 2,86
Ptgs1P22437 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Ptgs1P22437 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,85
Ptgs1P22437 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,82■■■□□ 2,84
Ptgs1P22437 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Ptgs1P22437 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Ptgs1P22437 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,75■■■□□ 2,83
Ptgs1P22437 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Ptgs1P22437 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Ptgs1P22437 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Ptgs1P22437 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Ptgs1P22437 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Ptgs1P22437 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Ptgs1P22437 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Ptgs1P22437 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Ptgs1P22437 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Ptgs1P22437 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Ptgs1P22437 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Ptgs1P22437 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,98■■■□□ 2,71
Ptgs1P22437 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Ptgs1P22437 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Ptgs1P22437 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Ptgs1P22437 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Ptgs1P22437 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,76■■■□□ 2,67
Ptgs1P22437 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Ptgs1P22437 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,7■■■□□ 2,66
Ptgs1P22437 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Ptgs1P22437 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Ptgs1P22437 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,49■■■□□ 2,63
Ptgs1P22437 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Ptgs1P22437 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Ptgs1P22437 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Ptgs1P22437 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Ptgs1P22437 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Ptgs1P22437 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Ptgs1P22437 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Ptgs1P22437 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Ptgs1P22437 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Ptgs1P22437 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Ptgs1P22437 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Ptgs1P22437 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Ptgs1P22437 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Ptgs1P22437 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Ptgs1P22437 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Ptgs1P22437 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Ptgs1P22437 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Ptgs1P22437 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Ptgs1P22437 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Ptgs1P22437 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Ptgs1P22437 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Ptgs1P22437 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Ptgs1P22437 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Ptgs1P22437 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Ptgs1P22437 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Ptgs1P22437 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Ptgs1P22437 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Ptgs1P22437 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
Ptgs1P22437 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Ptgs1P22437 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Ptgs1P22437 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Ptgs1P22437 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ptgs1P22437 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Ptgs1P22437 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ptgs1P22437 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Ptgs1P22437 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Ptgs1P22437 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Ptgs1P22437 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Ptgs1P22437 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Ptgs1P22437 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ptgs1P22437 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Ptgs1P22437 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Ptgs1P22437 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Ptgs1P22437 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Ptgs1P22437 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ptgs1P22437 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Ptgs1P22437 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ptgs1P22437 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ptgs1P22437 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,2 ms