Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Stx6Q9JKK1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Stx6Q9JKK1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Stx6Q9JKK1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Stx6Q9JKK1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Stx6Q9JKK1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Stx6Q9JKK1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Stx6Q9JKK1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Stx6Q9JKK1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Stx6Q9JKK1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Stx6Q9JKK1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Stx6Q9JKK1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Stx6Q9JKK1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Stx6Q9JKK1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Stx6Q9JKK1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Stx6Q9JKK1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Stx6Q9JKK1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Stx6Q9JKK1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Stx6Q9JKK1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Stx6Q9JKK1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Stx6Q9JKK1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Stx6Q9JKK1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Stx6Q9JKK1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Stx6Q9JKK1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Stx6Q9JKK1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Stx6Q9JKK1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Stx6Q9JKK1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Stx6Q9JKK1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Stx6Q9JKK1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Stx6Q9JKK1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Stx6Q9JKK1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Stx6Q9JKK1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Stx6Q9JKK1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Stx6Q9JKK1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Stx6Q9JKK1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Stx6Q9JKK1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Stx6Q9JKK1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Stx6Q9JKK1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Stx6Q9JKK1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Stx6Q9JKK1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Stx6Q9JKK1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Stx6Q9JKK1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Stx6Q9JKK1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Stx6Q9JKK1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Stx6Q9JKK1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Stx6Q9JKK1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Stx6Q9JKK1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Stx6Q9JKK1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Stx6Q9JKK1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Stx6Q9JKK1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Stx6Q9JKK1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Stx6Q9JKK1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Stx6Q9JKK1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Stx6Q9JKK1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Stx6Q9JKK1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Stx6Q9JKK1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Stx6Q9JKK1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Stx6Q9JKK1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Stx6Q9JKK1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Stx6Q9JKK1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Stx6Q9JKK1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Stx6Q9JKK1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Stx6Q9JKK1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Stx6Q9JKK1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Stx6Q9JKK1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Stx6Q9JKK1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Stx6Q9JKK1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Stx6Q9JKK1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Stx6Q9JKK1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Stx6Q9JKK1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Stx6Q9JKK1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Stx6Q9JKK1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Stx6Q9JKK1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Stx6Q9JKK1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Stx6Q9JKK1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Stx6Q9JKK1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Stx6Q9JKK1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Stx6Q9JKK1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Stx6Q9JKK1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Stx6Q9JKK1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Stx6Q9JKK1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Stx6Q9JKK1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Stx6Q9JKK1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Stx6Q9JKK1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Stx6Q9JKK1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Stx6Q9JKK1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Stx6Q9JKK1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Stx6Q9JKK1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Stx6Q9JKK1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Stx6Q9JKK1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Stx6Q9JKK1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Stx6Q9JKK1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Stx6Q9JKK1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Stx6Q9JKK1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Stx6Q9JKK1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Stx6Q9JKK1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Stx6Q9JKK1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Stx6Q9JKK1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Stx6Q9JKK1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Stx6Q9JKK1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms