Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,4■■■■■ 5,02
Nphp3Q7TNH6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Nphp3Q7TNH6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Nphp3Q7TNH6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Nphp3Q7TNH6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,76■■■■■ 4,12
Nphp3Q7TNH6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,19■■■■■ 4,02
Nphp3Q7TNH6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,01
Nphp3Q7TNH6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,99■■■■□ 3,99
Nphp3Q7TNH6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,64■■■■□ 3,94
Nphp3Q7TNH6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Nphp3Q7TNH6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Nphp3Q7TNH6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,74■■■■□ 3,79
Nphp3Q7TNH6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
Nphp3Q7TNH6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,77
Nphp3Q7TNH6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Nphp3Q7TNH6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,21■■■■□ 3,71
Nphp3Q7TNH6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38,1■■■■□ 3,69
Nphp3Q7TNH6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,68
Nphp3Q7TNH6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Nphp3Q7TNH6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Nphp3Q7TNH6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Nphp3Q7TNH6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Nphp3Q7TNH6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,55■■■■□ 3,6
Nphp3Q7TNH6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Nphp3Q7TNH6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Nphp3Q7TNH6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,41■■■■□ 3,58
Nphp3Q7TNH6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,33■■■■□ 3,57
Nphp3Q7TNH6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Nphp3Q7TNH6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,14■■■■□ 3,54
Nphp3Q7TNH6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,82■■■■□ 3,48
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Nphp3Q7TNH6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Nphp3Q7TNH6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Nphp3Q7TNH6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Nphp3Q7TNH6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Nphp3Q7TNH6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Nphp3Q7TNH6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Nphp3Q7TNH6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,59■■■■□ 3,45
Nphp3Q7TNH6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Nphp3Q7TNH6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Nphp3Q7TNH6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Nphp3Q7TNH6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Nphp3Q7TNH6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Nphp3Q7TNH6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Nphp3Q7TNH6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Nphp3Q7TNH6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Nphp3Q7TNH6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Nphp3Q7TNH6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Nphp3Q7TNH6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,87■■■■□ 3,33
Nphp3Q7TNH6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Nphp3Q7TNH6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,81■■■■□ 3,32
Nphp3Q7TNH6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,8■■■■□ 3,32
Nphp3Q7TNH6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Nphp3Q7TNH6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Nphp3Q7TNH6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Nphp3Q7TNH6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Nphp3Q7TNH6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Nphp3Q7TNH6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Nphp3Q7TNH6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Nphp3Q7TNH6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Nphp3Q7TNH6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Nphp3Q7TNH6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,29■■■■□ 3,24
Nphp3Q7TNH6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Nphp3Q7TNH6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,2■■■■□ 3,23
Nphp3Q7TNH6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Nphp3Q7TNH6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Nphp3Q7TNH6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Nphp3Q7TNH6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Nphp3Q7TNH6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Nphp3Q7TNH6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Nphp3Q7TNH6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Nphp3Q7TNH6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Nphp3Q7TNH6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Nphp3Q7TNH6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Nphp3Q7TNH6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Nphp3Q7TNH6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Nphp3Q7TNH6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,82■■■■□ 3,17
Nphp3Q7TNH6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Nphp3Q7TNH6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Nphp3Q7TNH6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,8■■■■□ 3,16
Nphp3Q7TNH6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,76■■■■□ 3,15
Nphp3Q7TNH6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Nphp3Q7TNH6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,75■■■■□ 3,15
Nphp3Q7TNH6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Nphp3Q7TNH6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,63■■■■□ 3,13
Nphp3Q7TNH6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Nphp3Q7TNH6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,58■■■■□ 3,13
Nphp3Q7TNH6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Nphp3Q7TNH6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Nphp3Q7TNH6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Nphp3Q7TNH6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Nphp3Q7TNH6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Nphp3Q7TNH6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,31■■■■□ 3,08
Nphp3Q7TNH6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Nphp3Q7TNH6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Nphp3Q7TNH6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Nphp3Q7TNH6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Nphp3Q7TNH6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Nphp3Q7TNH6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,8 ms