Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,37■■■■■ 4,05
Kif3aP28741 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Kif3aP28741 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Kif3aP28741 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Kif3aP28741 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,89■■■■□ 3,5
Kif3aP28741 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Kif3aP28741 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Kif3aP28741 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Kif3aP28741 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Kif3aP28741 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,26■■■■□ 3,4
Kif3aP28741 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Kif3aP28741 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Kif3aP28741 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Kif3aP28741 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,58■■■■□ 3,29
Kif3aP28741 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,58■■■■□ 3,29
Kif3aP28741 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kif3aP28741 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Kif3aP28741 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Kif3aP28741 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Kif3aP28741 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Kif3aP28741 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Kif3aP28741 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Kif3aP28741 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Kif3aP28741 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Kif3aP28741 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Kif3aP28741 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Kif3aP28741 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Kif3aP28741 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Kif3aP28741 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Kif3aP28741 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Kif3aP28741 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Kif3aP28741 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Kif3aP28741 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Kif3aP28741 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Kif3aP28741 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Kif3aP28741 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Kif3aP28741 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Kif3aP28741 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Kif3aP28741 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,92■■■■□ 3,02
Kif3aP28741 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Kif3aP28741 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,82■■■■□ 3
Kif3aP28741 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,74■■■□□ 2,99
Kif3aP28741 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Kif3aP28741 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Kif3aP28741 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Kif3aP28741 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Kif3aP28741 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Kif3aP28741 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Kif3aP28741 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Kif3aP28741 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Kif3aP28741 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Kif3aP28741 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,26■■■□□ 2,91
Kif3aP28741 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Kif3aP28741 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Kif3aP28741 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,98■■■□□ 2,87
Kif3aP28741 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Kif3aP28741 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Kif3aP28741 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Kif3aP28741 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Kif3aP28741 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
Kif3aP28741 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Kif3aP28741 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Kif3aP28741 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Kif3aP28741 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Kif3aP28741 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Kif3aP28741 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Kif3aP28741 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Kif3aP28741 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Kif3aP28741 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,51■■■□□ 2,8
Kif3aP28741 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Kif3aP28741 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Kif3aP28741 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Kif3aP28741 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Kif3aP28741 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Kif3aP28741 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Kif3aP28741 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Kif3aP28741 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Kif3aP28741 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Kif3aP28741 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Kif3aP28741 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Kif3aP28741 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Kif3aP28741 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Kif3aP28741 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Kif3aP28741 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Kif3aP28741 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Kif3aP28741 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Kif3aP28741 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Kif3aP28741 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Kif3aP28741 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,8■■■□□ 2,68
Kif3aP28741 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Kif3aP28741 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Kif3aP28741 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,68
Kif3aP28741 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Kif3aP28741 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Kif3aP28741 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Kif3aP28741 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Kif3aP28741 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Kif3aP28741 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Kif3aP28741 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Kif3aP28741 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,1 ms