Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Rps6ka5Q8C050 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Rps6ka5Q8C050 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Rps6ka5Q8C050 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Rps6ka5Q8C050 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Rps6ka5Q8C050 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36■■■■□ 3,35
Rps6ka5Q8C050 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Rps6ka5Q8C050 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Rps6ka5Q8C050 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Rps6ka5Q8C050 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Rps6ka5Q8C050 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Rps6ka5Q8C050 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Rps6ka5Q8C050 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Rps6ka5Q8C050 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Rps6ka5Q8C050 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Rps6ka5Q8C050 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Rps6ka5Q8C050 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Rps6ka5Q8C050 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Rps6ka5Q8C050 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Rps6ka5Q8C050 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Rps6ka5Q8C050 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Rps6ka5Q8C050 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,94■■■□□ 2,86
Rps6ka5Q8C050 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Rps6ka5Q8C050 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Rps6ka5Q8C050 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Rps6ka5Q8C050 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rps6ka5Q8C050 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Rps6ka5Q8C050 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Rps6ka5Q8C050 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Rps6ka5Q8C050 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Rps6ka5Q8C050 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Rps6ka5Q8C050 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
Rps6ka5Q8C050 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Rps6ka5Q8C050 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Rps6ka5Q8C050 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Rps6ka5Q8C050 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Rps6ka5Q8C050 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Rps6ka5Q8C050 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Rps6ka5Q8C050 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Rps6ka5Q8C050 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Rps6ka5Q8C050 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Rps6ka5Q8C050 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Rps6ka5Q8C050 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Rps6ka5Q8C050 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Rps6ka5Q8C050 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Rps6ka5Q8C050 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Rps6ka5Q8C050 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Rps6ka5Q8C050 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Rps6ka5Q8C050 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Rps6ka5Q8C050 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Rps6ka5Q8C050 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Rps6ka5Q8C050 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Rps6ka5Q8C050 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Rps6ka5Q8C050 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Rps6ka5Q8C050 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Rps6ka5Q8C050 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Rps6ka5Q8C050 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Rps6ka5Q8C050 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Rps6ka5Q8C050 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,95■■■□□ 2,55
Rps6ka5Q8C050 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Rps6ka5Q8C050 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Rps6ka5Q8C050 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Rps6ka5Q8C050 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Rps6ka5Q8C050 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Rps6ka5Q8C050 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Rps6ka5Q8C050 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Rps6ka5Q8C050 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Rps6ka5Q8C050 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Rps6ka5Q8C050 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Rps6ka5Q8C050 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Rps6ka5Q8C050 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Rps6ka5Q8C050 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,49
Rps6ka5Q8C050 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Rps6ka5Q8C050 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Rps6ka5Q8C050 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Rps6ka5Q8C050 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Rps6ka5Q8C050 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Rps6ka5Q8C050 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Rps6ka5Q8C050 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Rps6ka5Q8C050 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Rps6ka5Q8C050 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Rps6ka5Q8C050 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Rps6ka5Q8C050 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Rps6ka5Q8C050 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Rps6ka5Q8C050 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Rps6ka5Q8C050 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Rps6ka5Q8C050 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Rps6ka5Q8C050 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Rps6ka5Q8C050 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Rps6ka5Q8C050 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Rps6ka5Q8C050 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Rps6ka5Q8C050 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Rps6ka5Q8C050 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Rps6ka5Q8C050 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Rps6ka5Q8C050 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Rps6ka5Q8C050 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Rps6ka5Q8C050 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Rps6ka5Q8C050 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms