Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rps6ka5Q8C050 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rps6ka5Q8C050 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rps6ka5Q8C050 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rps6ka5Q8C050 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rps6ka5Q8C050 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Rps6ka5Q8C050 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rps6ka5Q8C050 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rps6ka5Q8C050 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rps6ka5Q8C050 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Rps6ka5Q8C050 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rps6ka5Q8C050 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rps6ka5Q8C050 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rps6ka5Q8C050 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rps6ka5Q8C050 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rps6ka5Q8C050 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rps6ka5Q8C050 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rps6ka5Q8C050 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rps6ka5Q8C050 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rps6ka5Q8C050 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rps6ka5Q8C050 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rps6ka5Q8C050 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Rps6ka5Q8C050 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rps6ka5Q8C050 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rps6ka5Q8C050 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rps6ka5Q8C050 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rps6ka5Q8C050 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rps6ka5Q8C050 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rps6ka5Q8C050 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rps6ka5Q8C050 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rps6ka5Q8C050 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rps6ka5Q8C050 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Rps6ka5Q8C050 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rps6ka5Q8C050 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rps6ka5Q8C050 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rps6ka5Q8C050 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rps6ka5Q8C050 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rps6ka5Q8C050 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Rps6ka5Q8C050 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rps6ka5Q8C050 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rps6ka5Q8C050 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rps6ka5Q8C050 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rps6ka5Q8C050 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rps6ka5Q8C050 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rps6ka5Q8C050 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rps6ka5Q8C050 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rps6ka5Q8C050 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rps6ka5Q8C050 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rps6ka5Q8C050 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rps6ka5Q8C050 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rps6ka5Q8C050 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rps6ka5Q8C050 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rps6ka5Q8C050 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rps6ka5Q8C050 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rps6ka5Q8C050 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rps6ka5Q8C050 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rps6ka5Q8C050 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rps6ka5Q8C050 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rps6ka5Q8C050 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Rps6ka5Q8C050 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rps6ka5Q8C050 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rps6ka5Q8C050 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rps6ka5Q8C050 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rps6ka5Q8C050 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rps6ka5Q8C050 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rps6ka5Q8C050 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rps6ka5Q8C050 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rps6ka5Q8C050 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rps6ka5Q8C050 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rps6ka5Q8C050 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rps6ka5Q8C050 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rps6ka5Q8C050 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Rps6ka5Q8C050 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rps6ka5Q8C050 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rps6ka5Q8C050 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rps6ka5Q8C050 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rps6ka5Q8C050 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rps6ka5Q8C050 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rps6ka5Q8C050 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rps6ka5Q8C050 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rps6ka5Q8C050 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rps6ka5Q8C050 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Rps6ka5Q8C050 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rps6ka5Q8C050 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Rps6ka5Q8C050 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rps6ka5Q8C050 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rps6ka5Q8C050 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Rps6ka5Q8C050 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rps6ka5Q8C050 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rps6ka5Q8C050 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rps6ka5Q8C050 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rps6ka5Q8C050 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rps6ka5Q8C050 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rps6ka5Q8C050 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rps6ka5Q8C050 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rps6ka5Q8C050 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rps6ka5Q8C050 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rps6ka5Q8C050 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms