Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,9■■■■■ 4,46
Gjb2Q00977 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Gjb2Q00977 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Gjb2Q00977 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,52■■■■□ 3,92
Gjb2Q00977 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Gjb2Q00977 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Gjb2Q00977 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,21■■■■□ 3,71
Gjb2Q00977 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38,14■■■■□ 3,7
Gjb2Q00977 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Gjb2Q00977 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,53■■■■□ 3,6
Gjb2Q00977 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Gjb2Q00977 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Gjb2Q00977 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,1■■■■□ 3,53
Gjb2Q00977 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,87■■■■□ 3,49
Gjb2Q00977 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Gjb2Q00977 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Gjb2Q00977 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Gjb2Q00977 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Gjb2Q00977 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Gjb2Q00977 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Gjb2Q00977 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Gjb2Q00977 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Gjb2Q00977 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Gjb2Q00977 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Gjb2Q00977 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Gjb2Q00977 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Gjb2Q00977 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,07■■■■□ 3,36
Gjb2Q00977 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Gjb2Q00977 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,89■■■■□ 3,34
Gjb2Q00977 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Gjb2Q00977 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Gjb2Q00977 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,71■■■■□ 3,31
Gjb2Q00977 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Gjb2Q00977 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Gjb2Q00977 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Gjb2Q00977 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Gjb2Q00977 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Gjb2Q00977 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Gjb2Q00977 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Gjb2Q00977 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Gjb2Q00977 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Gjb2Q00977 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Gjb2Q00977 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Gjb2Q00977 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Gjb2Q00977 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,9■■■■□ 3,18
Gjb2Q00977 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,86■■■■□ 3,17
Gjb2Q00977 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Gjb2Q00977 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Gjb2Q00977 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Gjb2Q00977 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Gjb2Q00977 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Gjb2Q00977 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Gjb2Q00977 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Gjb2Q00977 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Gjb2Q00977 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Gjb2Q00977 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Gjb2Q00977 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Gjb2Q00977 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Gjb2Q00977 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Gjb2Q00977 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Gjb2Q00977 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Gjb2Q00977 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Gjb2Q00977 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Gjb2Q00977 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Gjb2Q00977 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Gjb2Q00977 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Gjb2Q00977 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Gjb2Q00977 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Gjb2Q00977 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Gjb2Q00977 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Gjb2Q00977 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,64■■■□□ 2,98
Gjb2Q00977 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,63■■■□□ 2,97
Gjb2Q00977 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Gjb2Q00977 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Gjb2Q00977 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Gjb2Q00977 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Gjb2Q00977 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Gjb2Q00977 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Gjb2Q00977 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Gjb2Q00977 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Gjb2Q00977 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Gjb2Q00977 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Gjb2Q00977 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Gjb2Q00977 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Gjb2Q00977 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Gjb2Q00977 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Gjb2Q00977 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Gjb2Q00977 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Gjb2Q00977 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Gjb2Q00977 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Gjb2Q00977 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Gjb2Q00977 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Gjb2Q00977 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Gjb2Q00977 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Gjb2Q00977 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Gjb2Q00977 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Gjb2Q00977 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Gjb2Q00977 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Gjb2Q00977 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Gjb2Q00977 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms