Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
Gjb2Q00977 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Gjb2Q00977 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Gjb2Q00977 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Gjb2Q00977 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Gjb2Q00977 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Gjb2Q00977 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Gjb2Q00977 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Gjb2Q00977 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Gjb2Q00977 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Gjb2Q00977 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Gjb2Q00977 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Gjb2Q00977 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Gjb2Q00977 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Gjb2Q00977 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Gjb2Q00977 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Gjb2Q00977 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Gjb2Q00977 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Gjb2Q00977 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Gjb2Q00977 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Gjb2Q00977 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gjb2Q00977 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Gjb2Q00977 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Gjb2Q00977 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Gjb2Q00977 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gjb2Q00977 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gjb2Q00977 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Gjb2Q00977 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gjb2Q00977 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Gjb2Q00977 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Gjb2Q00977 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Gjb2Q00977 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Gjb2Q00977 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Gjb2Q00977 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gjb2Q00977 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Gjb2Q00977 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Gjb2Q00977 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Gjb2Q00977 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gjb2Q00977 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Gjb2Q00977 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Gjb2Q00977 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Gjb2Q00977 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Gjb2Q00977 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Gjb2Q00977 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Gjb2Q00977 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Gjb2Q00977 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Gjb2Q00977 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gjb2Q00977 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Gjb2Q00977 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gjb2Q00977 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gjb2Q00977 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Gjb2Q00977 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Gjb2Q00977 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Gjb2Q00977 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Gjb2Q00977 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gjb2Q00977 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Gjb2Q00977 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gjb2Q00977 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gjb2Q00977 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gjb2Q00977 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gjb2Q00977 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Gjb2Q00977 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gjb2Q00977 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gjb2Q00977 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gjb2Q00977 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gjb2Q00977 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gjb2Q00977 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gjb2Q00977 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gjb2Q00977 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Gjb2Q00977 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Gjb2Q00977 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Gjb2Q00977 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Gjb2Q00977 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gjb2Q00977 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Gjb2Q00977 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gjb2Q00977 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Gjb2Q00977 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gjb2Q00977 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gjb2Q00977 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gjb2Q00977 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gjb2Q00977 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gjb2Q00977 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gjb2Q00977 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gjb2Q00977 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gjb2Q00977 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gjb2Q00977 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gjb2Q00977 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gjb2Q00977 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gjb2Q00977 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Gjb2Q00977 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gjb2Q00977 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Gjb2Q00977 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Gjb2Q00977 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gjb2Q00977 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Gjb2Q00977 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Gjb2Q00977 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Gjb2Q00977 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Gjb2Q00977 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Gjb2Q00977 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Gjb2Q00977 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms