RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025804.5

Rab1b-201, Transcript of Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rab1b, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Map3k2Q61083 619 aa22.35■■□□□ 1.17
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Egfem1Q8C088 590 aa22.35■■□□□ 1.17
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rlbp1Q9Z275 317 aa22.35■■□□□ 1.17
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ttll7A4Q9F0 912 aa22.34■■□□□ 1.17
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cers3Q1A3B0 383 aa22.34■■□□□ 1.17
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa22.34■■□□□ 1.17
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Phf23Q8BSN5 401 aa22.34■■□□□ 1.17
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Syde2E9PUP1 1314 aa22.34■■□□□ 1.17
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Clcn1Q64347 994 aa22.34■■□□□ 1.17
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa22.34■■□□□ 1.17
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Pde4dQ01063 747 aa22.33■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Col4a1P02463 1669 aa22.32■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Abca3Q8R420 1704 aa22.32■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm12185Q5NCB2 835 aa22.32■■□□□ 1.16
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Trim52Q8CDV4 233 aa22.32■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Armcx1Q9CX83 456 aa22.32■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cluap1Q8R3P7 413 aa22.31■■□□□ 1.16
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ankle2Q6P1H6 964 aa22.31■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Triml2E9PW10 424 aa22.3■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Prkar2bP31324 416 aa22.3■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 GalcP54818 684 aa22.3■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Bend3Q6PAL0 825 aa22.29■■□□□ 1.16
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hspa2P17156 633 aa22.29■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Zap70P43404 618 aa22.29■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hs1bp3Q3TC93 395 aa22.28■■□□□ 1.16
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rgs17Q9QZB0 210 aa22.27■■□□□ 1.16
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Arhgap33Q80YF9 1305 aa22.27■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Bicdl1A0JNT9 577 aa22.26■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 B4galnt3Q6L8S8 986 aa22.26■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Kndc1Q0KK55 1742 aa22.26■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 MetP16056 1379 aa22.25■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Atl3Q91YH5 541 aa22.25■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sos2Q02384 1333 aa22.25■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 AU019823E9PUQ3 292 aa22.24■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Map3k13Q1HKZ5 959 aa22.24■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 HellsQ60848 821 aa22.24■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tm6sf1P58749 370 aa22.23■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ppm1mQ8BU27 406 aa22.23■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ipo9Q91YE6 1041 aa22.23■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Miga2Q8BK03 593 aa22.22■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Zbtb1Q91VL9 713 aa22.22■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Stk36Q69ZM6 1316 aa22.22■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa22.22■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Q8BT18 775 aa22.22■■□□□ 1.15
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa22.21■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 MypnQ5DTJ9 1315 aa22.21■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ddx60E9PZQ1 1711 aa22.2■■□□□ 1.15
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ric1Q69ZJ7 1422 aa22.2■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Dbr1Q923B1 550 aa22.2■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa22.2■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ddx58Q6Q899 926 aa22.19■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fkbp5Q64378 456 aa22.18■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Smarcc1P97496 1104 aa22.17■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa22.17■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Grm8P47743 908 aa22.17■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Vars2Q3U2A8 1060 aa22.17■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Trim27Q62158 513 aa22.17■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fam13aQ8BGI4 693 aa22.17■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa22.17■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Srgap3Q812A2 1099 aa22.15■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tlr7P58681 1050 aa22.15■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ccdc6D3YZP9 469 aa22.14■■□□□ 1.13
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Soga3Q6NZL0 945 aa22.14■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Snapc4Q8BP86 1333 aa22.14■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa22.13■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 NmiO35309 314 aa22.13■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cwc27Q3TKY6 469 aa22.13■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 SkilQ60665 675 aa22.13■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa22.13■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slfnl1Q8BHW9 410 aa22.13■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tceal9Q9DD24 104 aa22.13■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa22.12■■□□□ 1.13
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Prr5lA2AVJ5 370 aa22.11■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Atp8b2P98199 1209 aa22.11■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Adam1aQ60813 791 aa22.11■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ripor2Q80U16 1078 aa22.11■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa22.11■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm13023A2A8N2 498 aa22.1■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Myd88P22366 296 aa22.1■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Strn4P58404 760 aa22.1■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Wwc1Q5SXA9 1104 aa22.1■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa22.1■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Rab1b-201ENSMUST00000025804 AK157302I3ITR1 129 aa22.1■■□□□ 1.13
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