RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col4a1P02463 1669 aa29,55■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Erbb4Q61527 1308 aa29,54■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Esco1Q69Z69 843 aa29,54■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tgfb2P27090 414 aa29,53■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PsapQ61207 557 aaKnown RBP29,53■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CrbnQ8C7D2 445 aa29,53■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP29,52■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cfap70D3YVL2 1141 aa29,52■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem119Q8R138 280 aa29,52■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp16Q99LG0 825 aa29,52■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa29,52■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnn1Q9EQR3 537 aa29,52■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx60E9PZQ1 1711 aa29,51■■■□□ 2,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SympkQ80X82 1284 aa29,51■■■□□ 2,31
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atxn3Q9CVD2 355 aa29,51■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tktl2Q9D4D4 627 aa29,51■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dlg5E9Q9R9 1921 aa29,51■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slf2Q6P9P0 1278 aa29,5■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atf5O70191 283 aa29,49■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa29,49■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snai1Q02085 264 aa29,48■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sgip1Q8VD37 806 aa29,48■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf180Q3U827 592 aa29,47■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2c67Q569X9 491 aa29,47■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Neurod2Q62414 383 aa29,47■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim52Q8CDV4 233 aa29,47■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lama4P97927 1816 aa29,47■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prdm11A2AGX3 565 aa29,46■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Morc2aQ69ZX6 1030 aa29,45■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zcwpw1Q6IR42 630 aa29,45■■■□□ 2,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 StrcQ8VIM6 1809 aa29,44■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ralbp1Q62172 648 aa29,44■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plekhh1Q80TI1 1356 aa29,43■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP29,43■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Camkk2Q8C078 588 aa29,43■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa29,43■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa29,43■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taf1dQ9D4V4 322 aa29,43■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP29,43■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SowahdQ8BY98 327 aa29,42■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slurp2P0DP59 97 aa29,4■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ifit1bl2Q3U687 466 aa29,4■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankrd50F7BE84 1390 aa29,39■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP29,39■■■□□ 2,3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa29,38■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppef1O35655 650 aa29,37■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arid3aQ62431 601 aa29,37■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SnrkQ8VDU5 748 aa29,37■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ambra1A2AH22 1300 aa29,37■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP29,36■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IarsQ8BU30 1262 aa29,36■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2c69E9PXC3 491 aa29,35■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NudcO35685 332 aaKnown RBP29,35■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2c40P56657 491 aa29,35■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr162Q3UN16 588 aa29,35■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igfbp6P47880 238 aa29,34■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankle2Q6P1H6 964 aa29,34■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tango6Q8C3S2 1079 aa29,34■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ssc5dQ8BV57 1371 aa29,34■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttll7A4Q9F0 912 aa29,33■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Anks4bQ8K3X6 423 aa29,33■■■□□ 2,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim34aQ99PP6 485 aa29,32■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa29,32■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa29,31■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BcorQ8CGN4 1759 aa29,31■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP29,31■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cnksr1A2A9K7 700 aa29,3■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pde4bB1AWC9 736 aa29,29■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stox1B2RQL2 990 aa29,29■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa29,29■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TrhQ62361 256 aa29,29■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gimap8Q75N62 688 aa29,29■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q8C6G1 249 aa29,29■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa29,28■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ArsiQ32KI9 573 aa29,28■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adam1aQ60813 791 aa29,28■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FktnQ8R507 461 aa29,28■■■□□ 2,28
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ksr2Q3UVC0 959 aa29,27■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 St5Q924W7 1134 aa29,27■■■□□ 2,28
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Npy5rO70342 466 aa29,26■■■□□ 2,27
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc30Q8BVF4 654 aa29,25■■■□□ 2,27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP29,24■■■□□ 2,27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rtkn2Q14B46 604 aa29,24■■■□□ 2,27
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Duox1A2AQ92 1551 aa29,23■■■□□ 2,27
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa29,22■■■□□ 2,27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Itgb4A2A863 1818 aa29,22■■■□□ 2,27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hspa2P17156 633 aa29,21■■■□□ 2,27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP29,21■■■□□ 2,27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CoilQ5SU73 570 aa29,21■■■□□ 2,27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Irf9Q61179 399 aa29,21■■■□□ 2,27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dbndd1Q9CZ00 160 aa29,21■■■□□ 2,27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa29,21■■■□□ 2,27
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa29,2■■■□□ 2,26
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