Protein–RNA interactions for Protein: Q14B46

Rtkn2, Rhotekin-2, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtkn2Q14B46 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.76■■■■■ 5.4
Rtkn2Q14B46 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Rtkn2Q14B46 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Rtkn2Q14B46 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
Rtkn2Q14B46 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
Rtkn2Q14B46 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Rtkn2Q14B46 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rtkn2Q14B46 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rtkn2Q14B46 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Rtkn2Q14B46 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Rtkn2Q14B46 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
Rtkn2Q14B46 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Rtkn2Q14B46 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rtkn2Q14B46 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Rtkn2Q14B46 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rtkn2Q14B46 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
Rtkn2Q14B46 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Rtkn2Q14B46 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Rtkn2Q14B46 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rtkn2Q14B46 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rtkn2Q14B46 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rtkn2Q14B46 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
Rtkn2Q14B46 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rtkn2Q14B46 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rtkn2Q14B46 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rtkn2Q14B46 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rtkn2Q14B46 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Rtkn2Q14B46 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rtkn2Q14B46 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rtkn2Q14B46 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rtkn2Q14B46 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rtkn2Q14B46 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rtkn2Q14B46 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Rtkn2Q14B46 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rtkn2Q14B46 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rtkn2Q14B46 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rtkn2Q14B46 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rtkn2Q14B46 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rtkn2Q14B46 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rtkn2Q14B46 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rtkn2Q14B46 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rtkn2Q14B46 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Rtkn2Q14B46 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rtkn2Q14B46 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rtkn2Q14B46 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Rtkn2Q14B46 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rtkn2Q14B46 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rtkn2Q14B46 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Rtkn2Q14B46 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rtkn2Q14B46 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rtkn2Q14B46 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rtkn2Q14B46 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Rtkn2Q14B46 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rtkn2Q14B46 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rtkn2Q14B46 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rtkn2Q14B46 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Rtkn2Q14B46 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtkn2Q14B46 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rtkn2Q14B46 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rtkn2Q14B46 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rtkn2Q14B46 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rtkn2Q14B46 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rtkn2Q14B46 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rtkn2Q14B46 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rtkn2Q14B46 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rtkn2Q14B46 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rtkn2Q14B46 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rtkn2Q14B46 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Rtkn2Q14B46 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rtkn2Q14B46 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rtkn2Q14B46 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rtkn2Q14B46 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rtkn2Q14B46 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rtkn2Q14B46 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rtkn2Q14B46 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Rtkn2Q14B46 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rtkn2Q14B46 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rtkn2Q14B46 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rtkn2Q14B46 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rtkn2Q14B46 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rtkn2Q14B46 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rtkn2Q14B46 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rtkn2Q14B46 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rtkn2Q14B46 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rtkn2Q14B46 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rtkn2Q14B46 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rtkn2Q14B46 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rtkn2Q14B46 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rtkn2Q14B46 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rtkn2Q14B46 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rtkn2Q14B46 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rtkn2Q14B46 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rtkn2Q14B46 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rtkn2Q14B46 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rtkn2Q14B46 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Rtkn2Q14B46 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rtkn2Q14B46 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rtkn2Q14B46 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Rtkn2Q14B46 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rtkn2Q14B46 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms