RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C AIM26P32858 118 aa3.06□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C ALG3P38179 458 aa3.06□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C POL32P47110 350 aa3.06□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C YPL260WQ08977 551 aa3.06□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C PTC5Q12511 572 aa3.06□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C SEC8P32855 1065 aa3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C RPS26AP39938 119 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C RPS26BP39939 119 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C FYV10P40492 516 aa3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C ROD1Q02805 837 aa3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C YDR132CQ03900 495 aa3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C SPS1P08458 490 aa3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C HEM3P28789 327 aa3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C MCM2P29469 868 aa3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C PIK1P39104 1066 aa3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C TNA1P53322 534 aa3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C GCR1P07261 785 aa3.04□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C CCZ1P38273 704 aa3.04□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C RGD1P38339 666 aa3.04□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C MGE1P38523 228 aa3.04□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C SEC26P41810 973 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data3.04□□□□□ -1.92 RIP-Chip
HDA3YPR179C COQ4O13525 335 aa3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C DOM34P33309 386 aa3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C LAM1P38851 1228 aa3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C SPR28Q04921 423 aa3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C SGD1Q06132 899 aa3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C DBP5P20449 482 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C MEF2P39677 819 aa3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C GPB2P39717 880 aa3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C MPH1P40562 993 aa3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C RMD1Q03441 430 aa3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C SPO21Q12411 609 aa3.03□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C DED1P06634 604 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C SYP1P25623 870 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C DUT1P33317 147 aa3.02□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C SHM2P37291 469 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C TAT2P38967 592 aa3.02□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C CNN1P43618 361 aa3.02□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C GCN5Q03330 439 aa3.02□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C YER152CP10356 443 aa3.01□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C MRL1Q06815 381 aa3.01□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C YOR352WQ08816 343 aa3.01□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C CTS1P29029 562 aa3.01□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C RER2P35196 286 aa3.01□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C YFL054CP43549 646 aa3.01□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C DUS4Q06063 367 aa3.01□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C ATG13Q06628 738 aa3.01□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C RTT10Q08924 1013 aa3.01□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C CYC1P00044 109 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C TUB2P02557 457 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data3□□□□□ -1.93not detected
HDA3YPR179C ASF1P32447 279 aa3□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data3□□□□□ -1.93not detected
HDA3YPR179C TIF35Q04067 274 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C RIB2Q12362 591 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C SRM1P21827 482 aa3□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C MLS1P30952 554 aa3□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C RSB1Q08417 382 aa3□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C SPT20P50875 604 aa2.99□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C EEB1Q02891 456 aa2.99□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C SIZ1Q04195 904 aa2.99□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C CDC6P09119 513 aa2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C CDC34P14682 295 aa2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C RFC5P38251 354 aa2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C MET10P39692 1035 aa2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C PLB2Q03674 706 aa2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C RSM24Q03976 319 aa2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C TMA46Q12000 345 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C GNT1Q12096 491 aa2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C PNS1Q12412 539 aa2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C STE11P23561 717 aa2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C PNT1P38969 423 aa2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C URN1Q06525 465 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C DBP2P24783 546 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C LYP1P32487 611 aa2.97□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C SLA2P33338 968 aa2.97□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C TRM2P33753 639 aa2.97□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C MNR2P35724 969 aa2.97□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C PBP1P53297 722 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
HDA3YPR179C TRP2P00899 507 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C ACE2P21192 770 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C CDC20P26309 610 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C RAD27P26793 382 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C OYE2Q03558 400 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C ROT1Q03691 256 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C RXT3Q07458 294 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C PUS9Q12069 462 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C YPL066WQ12194 479 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C GAL10P04397 699 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C BAS1P22035 811 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C GEM1P39722 662 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C MXR1P40029 184 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.7 ms