RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A NPR1P22211 790 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A MSH3P25336 1018 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A EMC1P25574 760 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A PEP12P32854 288 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SRP101P32916 621 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A ADD66P36040 267 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SHR5P41912 237 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A DAS1P47005 663 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A GCV2P49095 1034 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SLK19Q08581 821 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A AFT2Q08957 416 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SWM1Q12379 170 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A PRP6P19735 899 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A PRP40P33203 583 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A QNS1P38795 714 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SEC26P41810 973 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A GFA1P14742 717 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A DMC1P25453 334 aa1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A KIP1P28742 1111 aa1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A MOT2P34909 587 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A TAT2P38967 592 aa1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YER158CP40095 573 aa1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A SRP1Q02821 542 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A GCN5Q03330 439 aa1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YSC84P32793 468 aa1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A TFA2P36145 328 aa1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A TRS120Q04183 1289 aa1.21□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A ORC2P32833 620 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A STM1P39015 273 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A SNM1P40993 198 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A CDA2Q06703 312 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YAP7Q08182 245 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A MCH5Q08777 521 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A TAD3Q9URQ3 322 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A RPA135P22138 1203 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A MLS1P30952 554 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A ALG3P38179 458 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A LEO1P38439 464 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YBP2P53169 641 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A DAM1P53267 343 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A EAR1Q03212 550 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A BDF2Q07442 638 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A SEC20P28791 383 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A ARL1P38116 183 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A TAF1P46677 1066 aa1.2□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A RPT1P33299 467 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A SPC42P36094 363 aa1.19□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YRO2P38079 344 aa1.19□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A ALT1P52893 592 aa1.19□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YDR306CQ06640 478 aa1.19□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A MEF2P39677 819 aa1.19□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A ATF1P40353 525 aa1.19□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A AAT1Q01802 451 aa1.19□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YPL260WQ08977 551 aa1.19□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A FAL1Q12099 399 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A PIK1P39104 1066 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YAP6Q03935 383 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A HSF1P10961 833 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YKL107WP34251 309 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A APT2P36973 181 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A NUT1P53114 1132 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YLR224WQ05947 369 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A NUP1P20676 1076 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A CCR4P31384 837 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A RGD2P43556 714 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A HDA2Q06629 674 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YIG1Q08956 461 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A PUS9Q12069 462 aa1.18□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A PMI40P29952 429 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YHL050CP38721 697 aa1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A PCL5P38794 229 aa1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YHR219WP38900 624 aa1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A CEP3P40969 608 aa1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A DUS3Q06053 668 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A FLP1P03870 423 aa1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A SEC8P32855 1065 aa1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A PZF1P39933 429 aa1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A ATG1P53104 897 aa1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A PPM2Q08282 695 aa1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A LSO1Q3E827 93 aa1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A CUE2P36075 443 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A ERP5P38819 212 aa1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A PLB1P39105 664 aa1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A ACF4P47129 309 aa1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A NIT3P49954 291 aa1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A SUN4P53616 420 aa1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data1.16□□□□□ -2.22not detected
YPL060C-AYPL060C-A UTP5Q04177 643 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A TPO1Q07824 586 aa1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A HVG1P0CE11 249 aa1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A SYP1P25623 870 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A NEM1P38757 446 aa1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A BOL3P39724 118 aa1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A YIL108WP40483 696 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A KIN4Q01919 800 aa1.16□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A PRC1P00729 532 aa1.15□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A ADE8P04161 214 aa1.15□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A PEX7P39108 375 aa1.15□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A FKH2P41813 862 aa1.15□□□□□ -2.22
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