RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W SSM4P40318 1319 aa5.04□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W CHD1P32657 1468 aa5.03□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W YGR053CP53234 283 aa5.03□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W CYC7P00045 113 aa5.03□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W TRP3P00937 484 aa5.03□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W GDE1Q02979 1223 aa5.03□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W YPL260WQ08977 551 aa5.03□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W YOR1P53049 1477 aa5.02□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W DBP5P20449 482 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W RGD1P38339 666 aa5.02□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W TYW3P53177 273 aa5.02□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W KIP1P28742 1111 aa5.02□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W LYP1P32487 611 aa5.02□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W NMD3P38861 518 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W YJL045WP47052 634 aa5.02□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W EEB1Q02891 456 aa5.02□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W TRP2P00899 507 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W KRI1P42846 591 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W FAA4P47912 694 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W ALO1P54783 526 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data5.01□□□□□ -1.61not detected
HCA4YJL033W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W YKR073CP36153 106 aa5.01□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W VAC8P39968 578 aa5.01□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W TRE1Q08919 783 aa5.01□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W TOS1P38288 455 aa5□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W HNT2P49775 206 aa5□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W SPO20Q04359 397 aa5□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W RPO31P04051 1460 aa5□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W MLS1P30952 554 aa5□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W YSC84P32793 468 aa5□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W YHL012WP38709 493 aa5□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W ALD6P54115 500 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W SPO21Q12411 609 aa5□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W OMA1P36163 345 aa4.99□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W MCM7P38132 845 aa4.99□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W RPN3P40016 523 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W MPH1P40562 993 aa4.99□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W URN1Q06525 465 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W AOS1Q06624 347 aa4.99□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W MDL2P33311 773 aa4.98□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W PEX7P39108 375 aa4.98□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W SAM35P14693 329 aa4.98□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W SRO9P25567 434 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data4.98□□□□□ -1.61not detected
HCA4YJL033W GPB2P39717 880 aa4.98□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W SNF7P39929 240 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W ADP1P25371 1049 aa4.97□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W INP52P50942 1183 aa4.97□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W GNT1Q12096 491 aa4.97□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W RKM4Q12504 494 aa4.97□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W COQ4O13525 335 aa4.97□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W INO1P11986 533 aa4.97□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W MAC1P35192 417 aa4.97□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W TNA1P53322 534 aa4.97□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W PRO1P32264 428 aa4.96□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W LIP5P32875 414 aa4.96□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W BRE4Q07660 1125 aa4.96□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W OPI10Q08202 246 aa4.96□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
HCA4YJL033W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W YER152CP10356 443 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data4.96□□□□□ -1.62not detected
HCA4YJL033W BAP2P38084 609 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W ENP1P38333 483 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W SSY1Q03770 852 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W TY2B-FP0CX63 1770 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W TY2B-CP25384 1770 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W TY2B-DR2Q03494 1770 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W TY1B-DR1Q03855 1755 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W TY2B-OR1Q12113 1770 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W TY2B-DR1Q12472 1770 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W TY2B-OR2Q12501 1770 aa4.96□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W BAS1P22035 811 aa4.95□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W YKL107WP34251 309 aa4.95□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W MOT2P34909 587 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W CCZ1P38273 704 aa4.95□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W PTC7P38797 343 aa4.95□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W SDH1Q00711 640 aa4.95□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W AGP1P25376 633 aa4.95□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data4.95□□□□□ -1.62not detected
HCA4YJL033W SMC4Q12267 1418 aa4.95□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W GTS1P40956 396 aa4.94□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
HCA4YJL033W CTH1P47976 325 aa4.94□□□□□ -1.62
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