RNA–Protein interactions for RNA: YHR081W

LRP1, Transcript of Nuclear exosome-associated nucleic acid binding protein, yeast

Gene LRP1, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LRP1	YHR081W	MET10	P39692	1035 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	MPH1	P40562	993 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	MDL2	P33311	773 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	MNR2	P35724	969 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	RGD1	P38339	666 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
LRP1	YHR081W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	VPS16	Q03308	798 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	DFG16	Q99234	619 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	INO1	P11986	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	SNF5	P18480	905 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	LYP1	P32487	611 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	SEG2	P34250	1132 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	MAD1	P40957	749 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	AVT1	P47082	602 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	TYW3	P53177	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	COQ4	O13525	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	TNA1	P53322	534 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	CWC24	P53769	259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	RSC58	Q07979	502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	PIN2	Q12057	282 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	PRI2	P20457	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	BAP2	P38084	609 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	MXR1	P40029	184 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	HNT2	P49775	206 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	YGR053C	P53234	283 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	CLN2	P20438	545 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	BAS1	P22035	811 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	RNQ1	P25367	405 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	YKL069W	P36088	180 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	VAC8	P39968	578 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	ORC3	P54790	616 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	SVF1	Q05515	481 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LRP1	YHR081W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	CCZ1	P38273	704 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	YGL176C	P46945	554 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	PIK1	P39104	1066 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	RSB1	Q08417	382 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	GNT1	Q12096	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	SPS1	P08458	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	YKL107W	P34251	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	IRC24	P40580	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	SPO20	Q04359	397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	ECL1	P48235	211 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
LRP1	YHR081W	OPI10	Q08202	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	RKM4	Q12504	494 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	UGA2	P38067	497 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	PNT1	P38969	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	MBP1	P39678	833 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	CDA2	Q06703	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	BI4	P03879	638 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	ELM1	P32801	640 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	SLA2	P33338	968 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	MRPL22	P53881	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRP1	YHR081W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	ACM1	Q08981	209 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	SVS1	Q12254	260 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	VBA5	P36172	582 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	AGP1	P25376	633 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	RFC5	P38251	354 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	CMP2	P14747	604 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	SRM1	P21827	482 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	YKL151C	P36059	337 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	ROT1	Q03691	256 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	GAL10	P04397	699 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	ACE2	P21192	770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	APL1	P27351	700 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	STE5	P32917	917 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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