RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W PTC5Q12511 572 aa5.39□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W KIP1P28742 1111 aa5.38□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W AFG2P32794 780 aa5.38□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W PIC2P40035 300 aa5.38□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W TNA1P53322 534 aa5.38□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W YML020WQ03722 664 aa5.38□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W RSB1Q08417 382 aa5.38□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W PUS9Q12069 462 aa5.38□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W MCD1Q12158 566 aa5.38□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W MRPS18P42847 217 aa5.37□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W YGR122WP53272 402 aa5.37□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W URN1Q06525 465 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W DED1P06634 604 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W IPL1P38991 367 aa5.36□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W PIK1P39104 1066 aa5.36□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W YPL260WQ08977 551 aa5.36□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W PRE9P23638 258 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W ALG3P38179 458 aa5.35□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W RPN3P40016 523 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W MSE1P48525 536 aa5.35□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W ROT1Q03691 256 aa5.35□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W DUS4Q06063 367 aa5.35□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W GPB2P39717 880 aa5.34□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W ENT3P47160 408 aa5.34□□□□□ -1.55
NSE4YDL105W STE11P23561 717 aa5.33□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W RSM24Q03976 319 aa5.33□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W RXT3Q07458 294 aa5.33□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W SPO21Q12411 609 aa5.33□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W HCM1P25364 564 aa5.32□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W MNN10P50108 393 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W SIW14P53965 281 aa5.32□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W PLB2Q03674 706 aa5.32□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W RAD2P07276 1031 aa5.31□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W SNF5P18480 905 aa5.31□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W YPT53P36019 220 aa5.31□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W MGE1P38523 228 aa5.31□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W PBP1P53297 722 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W ROD1Q02805 837 aa5.31□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W CDC20P26309 610 aa5.3□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W SEC8P32855 1065 aa5.3□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W RFC5P38251 354 aa5.3□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W CYC8P14922 966 aa5.29□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W PMI40P29952 429 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W MKK2P32491 506 aa5.29□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W RGD1P38339 666 aa5.29□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W GPB1Q08886 897 aa5.29□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W GAL10P04397 699 aa5.28□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W CMP2P14747 604 aa5.28□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W MRL1Q06815 381 aa5.28□□□□□ -1.56
NSE4YDL105W SYP1P25623 870 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W LST4P34239 828 aa5.27□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W SLI1P53304 468 aa5.27□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W TMA10Q06177 86 aa5.27□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W NTO1Q12311 748 aa5.27□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W HXT13P39924 564 aa5.26□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W CNN1P43618 361 aa5.26□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W POL32P47110 350 aa5.26□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W GNP1P48813 663 aa5.26□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W SUN4P53616 420 aa5.26□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W HXT17P53631 564 aa5.26□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W HXT15P54854 567 aa5.26□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W CTF4Q01454 927 aa5.26□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W CDC6P09119 513 aa5.25□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W SRM1P21827 482 aa5.25□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W HEM3P28789 327 aa5.25□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W AIM21P40563 679 aa5.25□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W GCR1P07261 785 aa5.24□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W DBP5P20449 482 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W MLS1P30952 554 aa5.24□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W YER152CP10356 443 aa5.23□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W RAD27P26793 382 aa5.23□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W MCM2P29469 868 aa5.23□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W YJR107WP47145 328 aa5.23□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W SVS1Q12254 260 aa5.23□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W VPS62P53285 467 aa5.22□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data5.22□□□□□ -1.57not detected
NSE4YDL105W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
NSE4YDL105W PMA1P05030 918 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W YFL054CP43549 646 aa5.21□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W SIZ1Q04195 904 aa5.21□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W YLR224WQ05947 369 aa5.21□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W ATG13Q06628 738 aa5.21□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W ATE1P16639 503 aa5.2□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W RAD53P22216 821 aa5.2□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W APL1P27351 700 aa5.2□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W DCG1P32460 244 aa5.2□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W MPH1P40562 993 aa5.2□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W YAP6Q03935 383 aa5.2□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W SPR28Q04921 423 aa5.2□□□□□ -1.58
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