RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000177504.8

Gm29394-204, Transcript of Predicted gene 29394, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene Gm29394, Length 448 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Plin1Q8CGN5 517 aa26.66■■□□□ 1.86
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Spef2Q8C9J3 1734 aa26.65■■□□□ 1.86
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Kndc1Q0KK55 1742 aa26.65■■□□□ 1.86
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Tlr8P58682 1032 aa26.64■■□□□ 1.86
Gm29394-204ENSMUST00000177504 1810065E05RikQ5NC41 235 aa26.64■■□□□ 1.86
Gm29394-204ENSMUST00000177504 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Cap2Q9CYT6 476 aa26.64■■□□□ 1.86
Gm29394-204ENSMUST00000177504 P2rx7Q9Z1M0 595 aa26.64■■□□□ 1.86
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Zfyve9A2A8R0 1397 aa26.63■■□□□ 1.85
Gm29394-204ENSMUST00000177504 ArsiQ32KI9 573 aa26.61■■□□□ 1.85
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa26.61■■□□□ 1.85
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Chmp7Q8R1T1 451 aa26.6■■□□□ 1.85
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Aox2Q5SGK3 1345 aa26.59■■□□□ 1.85
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa26.58■■□□□ 1.85
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Cfap70D3YVL2 1141 aa26.58■■□□□ 1.85
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa26.57■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Akap2O54931 893 aa26.56■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Mcm10Q0VBD2 885 aa26.56■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 HypkQ9CR41 129 aa26.55■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 TrhQ62361 256 aa26.54■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Amhr2Q8K592 568 aa26.54■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Amotl1Q9D4H4 968 aa26.54■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Cyp2c68K7N6C2 491 aa26.53■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Itgb4A2A863 1818 aa26.53■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 TnikP83510 1323 aa26.52■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 NogP97466 232 aa26.52■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 PalmQ9Z0P4 383 aa26.52■■□□□ 1.84
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Zfp777B9EKF4 885 aa26.5■■□□□ 1.83
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Nkx2-3P97334 362 aa26.49■■□□□ 1.83
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Lrrc43Q3V0L5 667 aa26.49■■□□□ 1.83
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa26.48■■□□□ 1.83
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa26.47■■□□□ 1.83
Gm29394-204ENSMUST00000177504 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa26.46■■□□□ 1.83
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa26.46■■□□□ 1.83
Gm29394-204ENSMUST00000177504 B4galnt4Q766D5 1034 aa26.45■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Slfnl1Q8BHW9 410 aa26.45■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Nav1Q8CH77 1875 aa26.45■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa26.44■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 IarsQ8BU30 1262 aa26.44■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 AceP09470 1312 aa26.43■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 EgfrQ01279 1210 aa26.43■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Klrk1O54709 232 aa26.42■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Ccdc155Q80VJ8 648 aa26.42■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Slurp2P0DP59 97 aa26.4■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Nlrp6Q91WS2 869 aa26.4■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Klhdc4Q921I2 584 aa26.4■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Col24a1Q30D77 1733 aa26.39■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Col4a5Q63ZW6 1691 aa26.39■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Pde4dQ01063 747 aa26.39■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Tsen2Q6P7W5 460 aa26.39■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Atp1b3P97370 278 aa26.38■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Golgb1E9PVZ8 3238 aa26.37■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Wdhd1P59328 1117 aa26.37■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Stk31Q99MW1 1018 aa26.37■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Adcy9P51830 1353 aa26.36■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa26.36■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 VwdeQ6DFV8 926 aa26.36■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Snap23O09044 210 aa26.35■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Tango6Q8C3S2 1079 aa26.35■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa26.35■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Efcab2Q9CQ46 164 aa26.34■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Tktl2Q9D4D4 627 aa26.34■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Syde2E9PUP1 1314 aa26.34■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Clcn1Q64347 994 aa26.33■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Ubn2Q80WC1 1314 aa26.33■■□□□ 1.81
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa26.32■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Zbtb1Q91VL9 713 aa26.31■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 GsdmaQ9EST1 446 aa26.3■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Cabp2Q9JLK4 216 aa26.3■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Trip6Q9Z1Y4 480 aa26.3■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 PgfP49764 158 aa26.28■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Podxl2Q8CAE9 603 aa26.28■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Ciapin1Q8WTY4 309 aa26.28■■□□□ 1.8
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Col5a2Q3U962 1497 aa26.26■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 SobpQ0P5V2 864 aa26.26■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 PrimpolQ6P1E7 537 aa26.26■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Q8C6G1 249 aa26.26■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 MetP16056 1379 aa26.25■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Ambra1A2AH22 1300 aa26.25■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Gjd4Q8BSD4 364 aa26.24■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Dpf1Q9QX66 387 aa26.24■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Rbm46P86049 533 aa26.23■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Gja3Q64448 417 aa26.22■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa26.21■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Gm3043K7N693 218 aa26.21■■□□□ 1.79
Gm29394-204ENSMUST00000177504 Gm16440K7N6G6 218 aa26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.1 ms