RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rfx1P48377 963 aa16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppp6r3Q922D4 844 aa16.86■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GnpatP98192 678 aa16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dzip1Q8BMD2 852 aa16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bcar3Q9QZK2 820 aa16.85■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nphp1Q9QY53 687 aa16.84■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aox2Q5SGK3 1345 aa16.84■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atp8b2P98199 1209 aa16.83■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CoilQ5SU73 570 aa16.83■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dlg5E9Q9R9 1921 aa16.83■□□□□ 0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cnksr1A2A9K7 700 aa16.83■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa16.83■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Farp2Q91VS8 1065 aa16.83■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mmp8O70138 465 aa16.83■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cwc27Q3TKY6 469 aa16.83■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Btbd11Q6GQW0 1109 aa16.83■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TnrQ8BYI9 1358 aa16.83■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abcc12Q80WJ6 1366 aa16.82■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fkbp4P30416 458 aa16.82■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CalcaP70160 136 aa16.82■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Siglec1Q62230 1695 aa16.82■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Alpk3Q924C5 1678 aa16.82■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stk36Q69ZM6 1316 aa16.82■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 EngaseQ8BX80 734 aa16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcna6Q61923 529 aa16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9D2X8 372 aa16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col15a1O35206 1367 aa16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col1a2Q01149 1372 aa16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gli3Q61602 1583 aa16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10471E9Q1C7 252 aa16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bcl2l13P59017 434 aa16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dixdc1Q80Y83 711 aa16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zap70P43404 618 aa16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Exoc6bA6H5Z3 810 aa16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc155Q80VJ8 648 aa16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prune1Q8BIW1 454 aa16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mcmdc2E9Q956 681 aa16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tlr7P58681 1050 aa16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bend3Q6PAL0 825 aa16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Echdc1Q9D9V3 322 aa16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RestQ8VIG1 1082 aa16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hmox1P14901 289 aa16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 OptnQ8K3K8 584 aa16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zkscan2G3X952 960 aa16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ddit3P35639 168 aa16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Simc1E9Q6E9 1354 aa16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adcy9P51830 1353 aa16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spryd3E9Q9B3 442 aa16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ier5O89113 308 aa16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21698A0A087WQP8 267 aa16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21671G3UY31 267 aa16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ssh1Q76I79 1042 aa16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GckrQ91X44 587 aa16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pdzd9Q9D9M4 266 aa16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Map3k13Q1HKZ5 959 aa16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Erc2Q6PH08 957 aa16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wnk3Q80XP9 1757 aa16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TkfcQ8VC30 578 aa16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atg3Q9CPX6 314 aa16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col18a1P39061 1774 aa16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CrklP47941 303 aa16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rsph3aQ3UFY4 516 aa16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atf3Q60765 181 aa16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ThemisQ8BGW0 636 aa16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BcorQ8CGN4 1759 aa16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atp10bB1AWN4 1474 aa16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Map3k2Q61083 619 aa16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PsapQ61207 557 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Amigo3Q8C2S7 508 aa16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem119Q8R138 280 aa16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zranb3Q6NZP1 1069 aa16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SympkQ80X82 1284 aa16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plcb2A3KGF7 1181 aa16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tgfb1i1Q62219 461 aa16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rapgef3Q8VCC8 918 aa16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zkscan16A2ALW2 728 aa16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Card10P58660 1021 aa16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Phkg2Q9DB30 406 aa16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Taf7Q9R1C0 341 aa16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igfbp6P47880 238 aa16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 66.6 ms