Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49,36■■■■■ 5,49
Col1a2Q01149 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,61■■■■■ 4,89
Col1a2Q01149 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,89■■■■■ 4,78
Col1a2Q01149 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,21■■■■■ 4,51
Col1a2Q01149 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,81■■■■■ 4,44
Col1a2Q01149 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Col1a2Q01149 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,34■■■■■ 4,37
Col1a2Q01149 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,91■■■■■ 4,3
Col1a2Q01149 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,8■■■■■ 4,28
Col1a2Q01149 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,66■■■■■ 4,26
Col1a2Q01149 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,29■■■■■ 4,2
Col1a2Q01149 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,25■■■■■ 4,19
Col1a2Q01149 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41,19■■■■■ 4,18
Col1a2Q01149 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Col1a2Q01149 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Col1a2Q01149 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Col1a2Q01149 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,11■■■■■ 4,01
Col1a2Q01149 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
Col1a2Q01149 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39,81■■■■□ 3,96
Col1a2Q01149 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,79■■■■□ 3,96
Col1a2Q01149 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Col1a2Q01149 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,6■■■■□ 3,93
Col1a2Q01149 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Col1a2Q01149 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Col1a2Q01149 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Col1a2Q01149 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Col1a2Q01149 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Col1a2Q01149 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,33■■■■□ 3,89
Col1a2Q01149 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,32■■■■□ 3,89
Col1a2Q01149 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,3■■■■□ 3,88
Col1a2Q01149 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Col1a2Q01149 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Col1a2Q01149 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Col1a2Q01149 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Col1a2Q01149 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,94■■■■□ 3,82
Col1a2Q01149 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,84■■■■□ 3,81
Col1a2Q01149 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Col1a2Q01149 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,55■■■■□ 3,76
Col1a2Q01149 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Col1a2Q01149 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,2■■■■□ 3,71
Col1a2Q01149 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Col1a2Q01149 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Col1a2Q01149 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,69
Col1a2Q01149 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38,02■■■■□ 3,68
Col1a2Q01149 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Col1a2Q01149 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37,88■■■■□ 3,65
Col1a2Q01149 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Col1a2Q01149 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Col1a2Q01149 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,83■■■■□ 3,65
Col1a2Q01149 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,73■■■■□ 3,63
Col1a2Q01149 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Col1a2Q01149 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,65■■■■□ 3,62
Col1a2Q01149 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Col1a2Q01149 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Col1a2Q01149 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Col1a2Q01149 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,35■■■■□ 3,57
Col1a2Q01149 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Col1a2Q01149 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Col1a2Q01149 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Col1a2Q01149 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,17■■■■□ 3,54
Col1a2Q01149 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Col1a2Q01149 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37,14■■■■□ 3,54
Col1a2Q01149 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Col1a2Q01149 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,07■■■■□ 3,52
Col1a2Q01149 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Col1a2Q01149 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Col1a2Q01149 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Col1a2Q01149 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Col1a2Q01149 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,81■■■■□ 3,48
Col1a2Q01149 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Col1a2Q01149 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,79■■■■□ 3,48
Col1a2Q01149 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Col1a2Q01149 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,75■■■■□ 3,47
Col1a2Q01149 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,71■■■■□ 3,47
Col1a2Q01149 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Col1a2Q01149 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Col1a2Q01149 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36,7■■■■□ 3,47
Col1a2Q01149 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Col1a2Q01149 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Col1a2Q01149 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,64■■■■□ 3,46
Col1a2Q01149 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Col1a2Q01149 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Col1a2Q01149 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,57■■■■□ 3,45
Col1a2Q01149 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Col1a2Q01149 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,46■■■■□ 3,43
Col1a2Q01149 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,4■■■■□ 3,42
Col1a2Q01149 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,4■■■■□ 3,42
Col1a2Q01149 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Col1a2Q01149 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Col1a2Q01149 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Col1a2Q01149 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Col1a2Q01149 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Col1a2Q01149 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Col1a2Q01149 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36,21■■■■□ 3,39
Col1a2Q01149 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Col1a2Q01149 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Col1a2Q01149 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Col1a2Q01149 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Col1a2Q01149 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Col1a2Q01149 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms