Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms