Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SH3BP1Q9Y3L3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SH3BP1Q9Y3L3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SH3BP1Q9Y3L3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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