Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED5Q9Y3A6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms