Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IGSF9BQ9UPX0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms