Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms