Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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