Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTNAP2Q9UHC6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms