Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms