Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS29Q9UBQ0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms