Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms