Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBRD1Q9NUN5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms