Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1Q9H875 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms