Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms