Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms