Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms