Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms