Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP58Q9BVL2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms