Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KATNB1Q9BVA0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms