Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFJQ9BTM1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms