Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms