Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms