Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms