Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms