Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC136Q96JN2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms