Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCC12Q96J65 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms