Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPNQ96H22 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPNQ96H22 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms