Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD4Q96CM3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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