Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPTQ96BT3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPTQ96BT3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms