Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms