Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms